醫事學院下設七個大學學制分別為醫學檢驗生物技術系、製藥工程系、生物科技系、視光系、語言治療系、寵物照護與美容系。三個研究所分別為生物醫學研究所，醫學檢驗生物技術系碩士班與視光系碩士班，五個專科學制分別為醫學檢驗生物技術、視光、生物醫學及美容保健科、製藥工程科與寵物照護與美容科。本院招收學制多元並配合業界所需與產業發展趨勢陸續申請相關科系所，藉以開拓兼實用和發展性的科技領域。醫事學院的發展方向以醫學科技與生技產品研發為基礎，以促進健康與實務應用為主軸，整合各系所之研發能量，落實台灣南部地區在地資源及產業結合永續發展，以善盡本學院醫學專業之社會效益。建立特色研發服務中心，提供教學實習及各種專業諮詢服務，期待透過各領域的整合，配合台灣醫學生技產業的趨勢，創造開創性生技教育之新契機。